Znakomity chirurg dziecięcy. Przez 20 lat kierował Kliniką Chirurgii i Urologii Dziecięcej wrocławskiej AM, którą przekształcił w jeden z najlepszych ośrodków w Polsce. Był autorem lub współautorem ponad 200 publikacji naukowych i wielu podręczników dla studentów i lekarzy. Do roku 2008 pełnił funkcję konsultanta krajowego z dziedziny chirurgii dziecięcej, odpowiadając m.in. za szkolenie polskich chirurgów. W latach 1993-99 był rektorem wrocławskiej uczelni; to on rozpoczął budowę szpitala przy ul. Borowskiej. - Profesor kochał dzieci. Zawsze powtarzał nam wszystkim żebyśmy leczyli je tak, jakbyśmy leczyli własne - wspominał dr Dariusz Patkowski, który przejął po profesorze kierowanie kliniką. Miesiąc przed śmiercią wrocławska AM przyznała prof. Czernikowi tytuł doktora honoris causa. Miał 72 lata.