Mąka musi być przechowywana w miejscu suchym oraz przewiewnym. Idealna temperatura w spiżarni nie powinna przekraczać +10 stopni Celsjusza. Mąka może być przechowywana tym dłużej im mniej zawiera otrąb (w których zawarty jest tłuszcz z zarodka). To właśnie pod wpływem wilgoci oraz ciepła tłuszcze ulegają rozpadowi. W wypadku mąki, zmieni ona swój kolor z lekkożółtawej na bardzo biała. Jeśli mąka była źle przechowywana to może zbić się w grudki - wtedy należy ja rozetrzeć na sicie i starać się ja jak najszybciej zużyć. Mąka przechowywana w dobrych warunkach może być użyta nawet do roku czasu (mąki gorszego gatunku, mąki ciemne jedynie kilka miesięcy).